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内容大纲
及时发现具有高临床价值的生物医学成果、促进其尽早转化,对于科研资源分配、科学政策制定以及人类健康促进等具有重要意义。生物医学论文是生物医学研究成果的主要表现形式之一,因此对其进行及时、合理的临床转化分析十分必要。如今数量庞大、增长迅速的生物医学论文,一方面为其临床转化分析提出了挑战,另一方面也为生物医学论文临床转化分析理论和方法研究提供了充足的数据资源。本书从转化过程的视角分析了生物医学论文临床价值的显现机理,在此基础上,提出了三个生物医学论文的临床转化分析理论框架。在方法和实证方面,本书提出了一个基于知识图谱的生物医学论文临床转化分析的方法框架,该框架由四个子方法组成:(1)融合多源数据的生物医学知识图谱构建方法;(2)基于知识图谱和表示学习的生物医学论文转化位置计算方法;(3)基于知识图谱和多特征融合的生物医学论文转化概率和转化强度预测方法和(4)验证性应用方法。同时,本书在实际科研问题和场景下,利用案例分析、统计分析等方法,探讨了前文提出的理论和方法的正确性和有用性。具体地,本书在药物研发、学术论文评价和学术搜索三个方面,展示了生物医学论文临床转化分析理论和方法的应用前景和价值。 -
作者介绍
李信,华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院讲师,硕士生导师。武汉大学与美国得克萨斯大学奥斯汀分校、印第安纳大学布鲁明顿分校联合培养博土。研究方向为文本挖掘、科技评价、信息组织、科技创新等。致力于从信息学的视角来分析和解决生物医学领域的现实问题。近年来,在SCI/SSCI/CSSCI期刊和重要国际会议发表学术论文数十篇,其中多篇被人大复印报刊资料和中国社会科学网全文转载。主持国家自然科学基金项目一项,参与国家社会科学重大项目等国家级课题多项。 -
目录
绪论
第一节 选题背景与研究意义
第二节 国内外研究现状分析
第三节 研究目的、研究框架和研究方法
第四节 研究创新点与章节安排
第一章 相关概念和理论基础
第一节 生物医学论文
第二节 转化医学模型
第三节 知识流动与知识转化
第四节 表示学习模型
第五节 机器学习模型
第二章 生物医学论文临床转化分析指标及方法框架
第一节 生物医学论文临床价值的显现机理
第二节 生物医学论文临床转化分析指标
第三节 基于知识图谱的生物医学论文临床转化分析方法框架
第四节 本章小结
第三章 融合多源数据的生物医学知识图谱构建
第一节 构建背景
第二节 多源数据集
第三节 实体和实体属性
第四节 实体消歧
第五节 实体关系
第六节 存储与更新
第七节 本章小结
第四章 生物医学论文的转化位置计算和分析
第一节 实验数据和预处理
第二节 基于知识图谱和实体表示学习的论文转化位置计算
第三节 基于知识图谱和文档表示学习的论文转化位置计算
第四节 结果分析
第五节 本章小结
第五章 生物医学论文的转化概率和转化强度预测
第一节 难点和可行性分析
第二节 探索性数据分析
第三节 训练数据和测试数据
第四节 特征构建
第五节 机器学习模型
第六节 实验及结果
第七节 本章小结
第六章 生物医学论文临床转化分析在科研问题中的应用
第一节 生物医学论文临床转化分析在药物研发中的应用
第二节 生物医学论文临床转化分析在学术论文评价中的应用
第三节 生物医学论文临床转化分析在学术搜索中的应用
第四节 本章小结
结语
附录A PubMed中论文的文献类型汇总表
附录B 9个生物医学研究主题的文献检索策略
参考文献
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