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内容大纲
本书系统介绍了癌症生物学的基础知识体系和前沿研究现状:前者涵盖了肿瘤的本质特征及分类、肿瘤细胞内分子生物学机制和特征(如癌症分子遗传和信号通路)、肿瘤微环境外部生物学机制(如肿瘤血管生成、肿瘤微环境、肿瘤免疫和肿瘤转移等);后者包括肿瘤基因组、肿瘤免疫治疗、人工智能大数据与肿瘤精准诊断治疗等内容,以及用于临床诊断和治疗的相关技术。本书从历史视角审视学科发展,全面展示了癌症研究的历史脉络、当前状况及未来趋势,旨在激发读者的批判性思维和创新意识。
本书适合作为生命科学类本科生和研究生的教材,也可供非临床医学类的肿瘤研究人员参考。 -
作者介绍
刘雪松:上海科技大学生命学院研究员、博士生导师、教授。研究方向聚焦肿瘤基因组及肿瘤精准诊断治疗。开发了拷贝数指纹标志物体系,提升了癌症早筛、复发预测、化疗及免疫治疗效果预测的精度,同时降低了检测成本;利用人工智能技术研发肿瘤新抗原及T细胞抗原受体预测工具,并应用于肿瘤精准免疫治疗实践。 -
目录
前言
第1章 肿瘤概述与流行病学
1.1 肿瘤研究概述
1.1.1 肿瘤基础理论的研究历程
1.1.2 肿瘤研究热点
1.2 恶性肿瘤的流行病学概述
1.2.1 世界范围的恶性肿瘤流行病学
1.2.2 中国的恶性肿瘤流行病学
1.3 肿瘤诊断与治疗概述
1.3.1 肿瘤发病机制研究历史
1.3.2 肿瘤常见诱发因素
1.3.3 肿瘤常见诊断方法
1.3.4 肿瘤常见治疗策略
1.4 肿瘤相关分子遗传学概述
1.4.1 遗传学概念
1.4.2 遗传与基因组学
1.4.3 人类基因组概况
1.4.4 基因组DNA变异类型
1.4.5 生殖系变异和体细胞变异
思考题
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第2章 肿瘤的分类及本质特征
2.1 肿瘤细胞的前身是正常机体细胞
2.1.1 组织固定与切片是常规病理检测的基础
2.1.2 苏木精-伊红染色是常规诊断的关键手段
2.2 肿瘤的分类
2.2.1 肿瘤的分期和分级
2.2.2 肿瘤对机体的影响
2.2.3 肿瘤细胞的来源
2.2.4 上皮细胞的定义与胚层来源
2.2.5 常见类型肿瘤
2.3 肿瘤的本质特征
2.3.1 肿瘤的本质特征
2.3.2 肿瘤的本质是单克隆性增殖
2.3.3 支持肿瘤单克隆起源的实验证据
2.4 癌症的代谢
2.4.1 瓦尔堡效应
2.4.2 瓦尔堡效应的临床应用
2.4.3 抗代谢物与肿瘤治疗
2.4.4 肿瘤代谢的概括性特征
2.5 诱变剂与致癌剂
2.5.1 化学物质会致癌
2.5.2 吸烟与癌症发生
2.5.3 费城染色体
2.5.4 诱变剂
2.5.5 诱变能力的检测
2.5.6 致癌剂
思考题
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第3章 肿瘤与病毒
3.1 癌症是不是传染病
3.1.1 癌症研究领域的第一个诺贝尔奖
3.1.2 劳斯与劳斯肉瘤病毒
3.2 常见病毒类型以及应用
3.2.1 病毒的分类
3.2.2 常见的疾病相关病毒
3.2.3 常用的病毒递送载体
3.3 肿瘤病毒与体外细胞转化
3.3.1 体外细胞培养技术
3.3.2 细胞转染实验
3.3.3 劳斯肉瘤病毒与细胞体外转化
3.3.4 体外转化细胞的特征
3.3.5 逆转录酶的发现改写中心法则
3.3.6 DNA病毒与细胞转化
3.4 瓦尔姆斯-毕晓普实验及其意义
3.4.1 瓦尔姆斯-毕晓普实验
3.4.2 病毒基因-原癌基因假说
3.4.3 病毒癌基因v-Src与细胞原癌基因c-Src
3.4.4 其他重要病毒癌基因
思考题
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第4章 从原癌基因到癌基因
4.1 病毒和非病毒来源的癌基因
4.1.1 基因、蛋白质名称的一般书写规则
4.1.2 人类肿瘤相关的病毒
4.1.3 人类肿瘤相关的微生物
4.2 非病毒癌基因与病毒来源癌基因
4.2.1 基因转染实验助力寻找非病毒癌基因
4.2.2 DNA印迹法
4.2.3 非病毒癌基因与病毒来源癌基因一致
4.3 常见癌基因
4.3.1 癌基因Src
4.3.2 癌基因Ras
4.3.3 癌基因Myc
4.3.4 癌基因ErbB
4.4 点突变将原癌基因转变为癌基因
4.4.1 DNA点突变及其类型
4.4.2 点突变将原癌基因Ras转变为癌基因
4.4.3 Ras基因家族
4.4.4 不同组织来源的肿瘤中有不同的RAS基因点突变
4.4.5 CTNNB1基因点突变
4.4.6 BRAF热点突变
4.4.7 IDH热点突变
4.4.8 组蛋白H
4.4.9 PIK3CA热点突变
4.4.10 EGFRL858R突变
4.5 基因扩增将原癌基因转变为癌基因
4.5.1 MYC原癌基因拷贝数扩增
4.5.2 EGFR扩增
4.5.3 MDM2扩增
4.6 染色体易位将原癌基因转变为癌基因
4.6.1 MYC基因染色体易位与伯基特淋巴瘤
4.6.2 BCR-ABL和慢性粒细胞白血病
4.6.3 PML-RARA和急性早幼粒细胞白血病
4.6.4 TMPRSS2-ERG和前列腺癌
4.7 原癌基因转变为癌基因的其他方式
思考题
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第5章 癌症与信号分子、受体
5.1 生长因子与受体酪氨酸激酶信号通路
5.1.1 生长因子
5.1.2 血小板衍生生长因子
5.1.3 PDGF和病毒癌基因sis
5.1.4 Src蛋白是酪氨酸激酶
5.1.5 激酶与底物
5.1.6 EGFR和erbB
5.1.7 EGFR是一个酪氨酸激酶
5.1.8 受体酪氨酸激酶分子结构和激活方式
5.1.9 受体二聚化与交互磷酸化
5.1.10 基因融合导致组成型二聚化受体
5.1.11 配体非依赖组成型Kit激活与胃肠道间质瘤
5.2 癌症与核受体、性激素
5.2.1 核受体
5.2.2 雄激素与前列腺癌
5.2.3 去势抵抗性前列腺癌
5.2.4 与乳腺癌
5.3 癌症与其他类型细胞受体
5.3.1 细胞因子及其受体
5.3.2 TGF-β受体信号通路
5.3.3 Notch以及受体
5.3.4 经典Wnt信号与Frizzled受体
5.3.5 整合素
5.4 Ras蛋白的功能与调控
5.4.1 Ras是一个小分子GTP酶
5.4.2 Ras蛋白的细胞定位
5.4.3 热点突变对RAS酶活性的影响
5.4.4 Ras从不可靶向变成可靶向的肿瘤靶点
思考题
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第6章 癌基因细胞内信号通路
6.1 癌基因信号通路与肿瘤
6.2 生长因子与受体型酪氨酸激酶信号通路
6.2.1 Ras处于生长因子受体信号通路的下游
6.2.2 酪氨酸激酶的蛋白质结构域
6.2.3 生长因子-Ras信号传导机制
6.2.4 Ras蛋白通过激活Ras效应蛋白发挥功能
6.2.5 Ras下游信号通路
6.3 GPCR信号通路
6.4 整合素信号通路
6.5 JAK-STAT信号通路
6.6 Wnt/β-连环素信号通路
6.7 Hippo-Yap信号通路
6.8 其他“双重定位”信号转导通路
6.8.1 NF-kB信号通路
6.8.2 Notch信号通路
6.8.3 Hedgehog信号通路
6.8.4 TGF-β信号通路
思考题
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第7章 抑癌基因
7.1 抑癌基因概念
7.2 抑癌基因研究历史
7.2.1 细胞融合实验与肿瘤的隐性表型
7.2.2 第一个抑癌基因RB的发现
7.2.3 二次打击假说
7.3 抑癌基因的功能分类及其失活机制
7.3.1 抑癌基因的功能分类
7.3.2 抑癌基因功能丧失的机制
7.4 典型抑癌基因的调控机制
7.4.1 抑癌基因RB
7.4.2 抑癌基因TP
7.4.3 抑癌基因NF
7.4.4 抑癌基因APC
7.4.5 抑癌基因VHL
7.4.6 抑癌基因PTEN
7.4.7 抑癌基因BRCA
7.4.8 抑癌基因TSC
思考题
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第8章 视网膜母细胞瘤蛋白及细胞周期调控与癌症
8.1 细胞周期检查点
8.1.1 细胞周期
8.1.2 细胞周期检查点
8.2 细胞周期调控的分子机制
8.2.1 细胞周期蛋白的周期性表达
8.2.2 细胞周期调控的核心CDK
8.2.3 cyclin-CDK复合体对细胞周期的调控
8.2.4 生长因子及受体信号通路对细胞周期的调控
8.2.5 泛素-蛋白酶体系统对细胞周期中的调控
8.3 Rb-E2F与细胞周期调控及癌症
8.3.1 Rb
8.3.2 Rb的细胞周期性磷酸化
8.3.3 E2F及其调节
8.3.4 癌症中E2F的角色
8.4 靶向CDK-Rb-E2F的肿瘤治疗策略
8.4.1 CDK抑制剂
8.4.2 直接靶向E2F活性的肿瘤治疗策略
8.4.3 E2F活性驱动的溶瘤病毒
思考题
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第9章 p53与肿瘤发生和治疗
9.1 p53的发现及功能
9.1.1 p53的发现
9.1.2 p53的功能
9.1.3 MDM2-p53负反馈
9.1.4 p53靶向的基因网络
9.2 TP53基因在人类肿瘤中的变异
9.2.1 TP53的热点突变
9.2.2 TP53的突变类型
9.2.3 TP53突变在肿瘤中的分布
9.3 p53蛋白的调控
9.3.1 p53的磷酸化修饰
9.3.2 p53的泛素化修饰
9.3.3 p53的乙酰化修饰
9.3.4 p53的甲基化修饰
9.3.5 突变型p53蛋白的调控
9.4 p53的靶向治疗策略
9.4.1 靶向p53错义突变肿瘤的小分子药物
9.4.2 靶向野生型p53肿瘤的治疗策略
9.4.3 蛋白水解靶向嵌合体的治疗策略
9.4.4 靶向截短的p
9.4.5 靶向获得性功能的突变p
9.4.6 基于p53的肿瘤免疫治疗
9.4.7 基于p53的疫苗
9.4.8 p53特异性抗体
9.4.9 基于p53的基因治疗
9.5 p53突变的合成致死靶点
9.5.1 合成致死的概念
9.5.2 p53突变的合成致死靶点
9.5.3 通过细胞周期停滞靶向突变型p
9.5.4 靶向与能量代谢相关的突变型p
9.5.5 突变型p53的其他潜在合成致死途径
9.6 p53与细胞死亡控制
9.6.1 细胞死亡概念及类型
9.6.2 p53介导的细胞死亡
思考题
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第10章 细胞永生化
10.1 细胞衰老
10.1.1 海弗里克极限
10.1.2 细胞衰老
10.1.3 细胞衰老标志物
10.1.4 细胞衰老与肿瘤
10.2 肿瘤细胞永生化
10.2.1 肿瘤演化历程
10.2.2 海拉细胞永生的秘密
10.2.3 体细胞永生化的天然屏障
10.3 端粒与端粒酶
10.3.1 端粒的发现
10.3.2 端粒的结构与功能
10.3.3 端粒酶的结构与功能
10.3.4 端粒功能障碍
10.3.5 端粒酶非依赖的替代端粒延长机制
10.4 永生化与肿瘤治疗
10.4.1 端粒与细胞衰老
10.4.2 消除衰老肿瘤细胞的治疗策略
10.4.3 靶向端粒维持的肿瘤治疗策略
思考题
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第11章 肿瘤的发生发展与演化
11.1 肿瘤演化中的独立驱动事件
11.1.1 肿瘤发生发展中需要几次独立驱动事件
11.1.2 促癌剂与肿瘤
11.1.3 肿瘤发生演化的中间状态
11.1.4 区域性癌变
11.2 肿瘤演化
11.2.1 肿瘤异质性
11.2.2 肿瘤演化路径模型
11.2.3 肿瘤演化路径对肿瘤诊断治疗的影响
11.2.4 达尔文进化论与木村资生中性进化论
11.2.5 肿瘤演化中的正选择、负选择和中性选择
11.2.6 dN/dS演化结果分析
11.3 肿瘤干细胞理论
11.3.1 肿瘤干细胞
11.3.2 肿瘤发生演化的理论模型
11.3.3 有关肿瘤干细胞理论的争议
11.3.4 癌症发生频率与组织干细胞分裂次数
11.4 炎症与癌症
11.4.1 慢性炎症概述
11.4.2 慢性炎症促进肿瘤发生发展
11.4.3 抗炎症药物抑制部分肿瘤发生
11.4.4 慢性炎症促进肿瘤发生发展的机制
11.4.5 炎症调控与肿瘤治疗
思考题
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第12章 基因组稳定性与癌症
12.1 基因组稳定性维持
12.1.1 基因组稳定性维持的研究
12.1.2 生物体避免突变累积的策略
12.2 DNA损伤
12.2.1 DNA暴露在水和氧中产生自发性损伤
12.2.2 DNA中的尿嘧啶
12.2.35 -甲基胞嘧啶脱氨基为胸腺嘧啶是一个诱变事件
12.2.4 腺嘌呤和鸟嘌呤也可以脱氨基
12.2.5 DNA碱基的丢失
12.2.6 DNA氧化损伤
12.2.7 DNA复制中错误碱基的掺入
12.2.8 电离辐射造成DNA损伤
12.2.9 紫外线辐射
12.2.10 烷化剂
12.3 DNA修复
12.3.1 损伤碱基的光致复活
12.3.2 碱基切除修复
12.3.3 核苷酸切除修复
12.3.4 错配修复
12.3.5 同源重组修复
12.3.6 非同源末端连接
12.4 DNA损伤修复与癌症
12.4.1 DNA损伤检测
12.4.2 错配修复缺陷和遗传性非息肉病性结直肠癌
12.4.3 微不稳定性
12.4.4 范科尼贫血
12.4.5 毛细血管扩张共济失调症
12.4.6 着色性干皮病
思考题
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第13章 肿瘤血管生成
13.1 肿瘤血管生成研究历史
13.2 肿瘤微环境的组成与功能
13.2.1 免疫细胞
13.2.2 基质细胞
13.2.3 细胞外基质
13.2.4 外泌体
13.3 肿瘤血管生成的过程、机制与调控
13.3.1 血管生成的过程和调控
13.3.2 肿瘤缺氧与血管生成
13.3.3 肿瘤血管与正常血管的区别
13.4 肿瘤抗血管生成的临床研究
13.4.1 抗血管生成治疗的历史和发展
13.4.2 临床批准的抗血管生成药物
13.4.3 抗血管生成治疗的局限性和不良反应
13.4.4 联合治疗——从血管破坏到血管正常化
13.5 小结
思考题
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第14章 肿瘤转移及其机制
14.1 肿瘤侵袭和转移
14.1.1 肿瘤转移路径
14.1.2 肿瘤转移研究的历史
14.1.3 肿瘤转移与生存率
14.1.4 转移肿瘤相关的基因组DNA变异
14.2 肿瘤转移的过程与机制
14.2.1 肿瘤细胞的侵袭和迁移
14.2.2 侵入血管
14.2.3 肿瘤细胞在循环系统中的生存
14.2.4 肿瘤细胞的外渗
14.2.5 肿瘤细胞在靶器官的转移定植
14.3 肿瘤转移的器官特异性
14.3.1 骨转移
14.3.2 脑转移
14.3.3 肝脏转移
14.3.4 肺转移
14.4 转移瘤的诊断和治疗
14.4.1 用于检测转移的成像技术
14.4.2 转移肿瘤的治疗方法
14.4.3 肿瘤转移靶向治疗策略
14.5 肿瘤转移的实验模型
14.5.1 基于细胞体外培养的模型
14.5.2 研究肿瘤转移的实验动物模型
14.5.3 实验模型的优点和局限性
14.6 肿瘤转移研究的新兴领域
思考题
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第15章 肿瘤免疫
15.1 肿瘤免疫学概述
15.2 肿瘤免疫基础理论
15.2.1 肿瘤抗原
15.2.2 MHC与抗原加工呈递
15.2.3 适应性免疫细胞
15.3 抗肿瘤的免疫监视和免疫效应机制
15.3.1 自然杀伤细胞的抗肿瘤免疫效应
15.3.2 巨噬细胞的抗肿瘤免疫效应
15.3.3 CD8 和CD4 T细胞介导的免疫效应机制
15.3.4 B细胞介导体液免疫应答
15.4 肿瘤的免疫逃逸机制
15.5 肿瘤的免疫治疗
15.5.1 非特异性免疫治疗
15.5.2 肿瘤疫苗
15.5.3 过继性细胞治疗
15.5.4 抗体被动免疫治疗
15.5.5 免疫检查点抑制剂
思考题
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第16章 肿瘤基因组
16.1 DNA测序方法与应用
16.1.1 测序技术发展简史
16.1.2 主流DNA测序技术
16.1.3 测序技术的应用
16.2 肿瘤基因组研究历史
16.3 肿瘤基因组常规分析
16.3.1 肿瘤基因组变异检测
16.3.2 肿瘤驱动突变及其识别方法
16.3.3 突变模式分析
16.3.4 肿瘤异质性与演化分析
16.4 肿瘤基因组研究展望
16.4.1 单细胞技术在肿瘤生物学中的应用
16.4.2 空间组学在肿瘤生物学中的应用
16.4.3 肿瘤基因组复杂变异规律与机制
16.4.4 肿瘤非编码变异功能
16.4.5 肿瘤基因组与肿瘤精准医疗
思考题
拓展阅读文献
第17章 肿瘤大数据与人工智能
17.1 肿瘤大数据
17.1.1 肿瘤大数据的特点及基本类型
17.1.2 肿瘤大数据主要资源、数据库和研究队列
17.2 人工智能概述
17.2.1 人工智能发展历史和现状
17.2.2 人工智能、机器学习、深度学习的区别
17.2.3 深度学习模型的原理和主要类别
17.3 人工智能在肿瘤研究中的应用
17.3.1 人工智能与肿瘤诊断
17.3.2 人工智能与肿瘤预后
17.3.3 人工智能与肿瘤治疗
17.3.4 人工智能与肿瘤突变检测
17.3.5 人工智能与药物研发
17.3.6 人工智能其他应用场景
思考题
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第18章 肿瘤精准诊断和治疗
18.1 肿瘤精准诊断
18.1.1 液体活检
18.1.2 肿瘤遗传和易感基因检测
18.1.3 肿瘤标志物检测
18.1.4 单细胞分析
18.1.5 人工智能与肿瘤精准诊断
18.2 肿瘤精准治疗
18.2.1 肿瘤常规化疗药物
18.2.2 肿瘤靶向治疗
18.2.3 肿瘤精准免疫治疗
18.3 小结
思考题
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索引
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