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生物信息学--基础及应用
所属分类：生物科学>>生物科学>>生物工程学作者：编者:王举//王兆月//田心出版社：清华大学
王举、王兆月、田心等编著的这本《生物信息学 --基础及应用》简要介绍生物信息学的发展历史、主要研究领域及应用前景，并重点讲述生物信息学的基本知识点和基本技术、方法，生物分子信息数据库的类型及应用，复杂疾病的生物信息学研究思路、方法和典型应用实例。每个知识单元均包括生物信息学基础知识点、应用生物信息学的基本方法、数据库和计算机软件，并通过生物信息学的典型应用案例培养学生分析问题、解决问题的能力。本书共分8章。第1章为绪论，主要介绍生物信息学发展的历史、当前主要的研究方向及应用，尤其是在医学研究中的应用前景。第2章介绍常用的生物信息学数据库以及相应的数据检索方法，重点讲述核酸序列数据库、蛋白质序列数据库和蛋白质结构数据库以及典型数据库的格式和使用方法。第3章介绍核酸和蛋白质序列的比对方法及应用，着重讲述双序列比对的原理和常用工具。第4章和第5章分别介绍核酸序列分析和基因组注释的主要内容、方法及工具。第6 章和第7章则分别介绍从蛋白质序列分析其基本理化性质、结构和功能的方法及其在研究中的应用。第8 章介绍生物信息学在人类复杂疾病的分子机理研究中的作用、主要方法和工具。本书是面向医学和生物学背景的本科生的生物信息学教材，也可供相关专业科研人员参考。
售价：15.60

生物信息学中的序列组装方法
所属分类：生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学作者：罗军伟|责编:仓小金出版社：中国矿大
本书主要包括十章。第1 章主要介绍了序列组装的意义、难点、步骤和评价，这些涉及序列组装的基础知识，是本书后续内容的基础。第2章介绍了一种基于insert size分布和双端读数的序列组装方法，该方法能够有效的获取更准确的组装结果。第3章介绍了一种内存低耗的序列组装方法，该方法能够在较小的内存空间上完成整个序列组装过程。第4章介绍了一种基于双端读数统计特征的scaffolding方法，该方法和同类方法相比能够取得更好的结果。第5章介绍了一种基于长读数和 contig分类的scaffolding方法，该方法利用长读数和 contig之间的比对结果，把 contig分成两类，然后分别进行处理。第6章介绍了一种gap填充评价方法，该方法提出了专门针对gap填充工具的评价指标。第7章介绍了一种基于读数分割策略的gap填充方法，该方法对每个gap区域，确定两个读数集合，并利用De Bruijn 图填充gap区域。第8章介绍了一种基于k-mer分布特征的长读数重叠区检测方法，该方法利用两条长读数之间的共有k-mers，确定其重叠区域。第9章介绍了一种基于Hi-C交互矩阵的contig 纠错方法，该方法能够对识别contig中的一些组装错误，并有利用后续的 scaffolding。第10章介绍了一种基于Hi-C读数的 scaffolding方法，该方法利用Hi-C比对数据。
售价：15.20

生物信息学与功能基因组学(原著第3版)(精)
所属分类：生物科学>>生物科学>>生物工程学作者：(美)乔纳森·佩夫斯纳|责编:邵桂林|译者:田卫东//赵兴明出版社：化学工业
《生物信息学与功能基因组学》先前的版本受到了广泛的欢迎，它为这一爆炸性的新学科提供了最广泛的介绍。本书已经进行了彻底的更新和扩展，它仍然是学生、教师和希望对生物信息学和基因组学的跨学科领域有所了解的专业人士的“首选”资源。在这个快速发展的领域中，采用了最新的方法和概念，本书的更新包括：对内容大规模的修订和重新组织，以方便教学和学习；增加了介绍下一代测序的新章节；提供了一个扩展的相关网站，由作者维护，提供完整的生物信息学教学课程，并经常对信息进行更新；更加强调计算方法，对软件工具如何工作以及命令行工具如何使用有清晰明确的指导，例如用于下一代序列分析软件，R编程语言和NCBI搜索工具。本书还辅以丰富的插图和500多个图片和表格，其中许多是为本书新创建的，使得更加清晰和容易理解。每章都包含学习目标和知识框，说明关键技术以及相关数学和统计学的原理、观点和需要注意的部分、讨论问题、计算机问题、多项选择测验、推荐阅读材料和可免费获得的软件列表。教师可以访问本书的配套网站，以获取补充信息，例如每章末尾的问题答案以及书中的所有图表，以供教学使用。本书作者还创建了一个网站，为学生和教师提供了大量的相关资源。本书是一部优秀的单本教材，适用于生物科学和计算机科学领域的本科生和研究生入门课程。对于使用生物信息学和基因组学工具研究特定问题的生物学家、开发计算机算法和数据库的生物信息学家和计算机科学家以及想要了解病毒、细菌、寄生虫或其他疾病基因组基础的医学研究人员和临床医生而言，本书也是不可或缺的资源。
售价：119.20

生物信息学实验指导(塔里木大学十四五规划特色教材)
所属分类：生物科学>>生物科学>>生物工程学作者：编者:罗晓霞//夏占峰//张晶|责编:张国锋出版社：中国农业科技
本书共设计了10个实验。第一章为绪论，主要介绍生物信息学发展的历史及在未来生命科学研究中的作用；第二章介绍常用的生物信息学数据库，重点讲述核酸序列数据库、蛋白质序列数据库和蛋白质结构数据库以及典型数据库的格式和使用方法；第三章主要介绍数据检索的原理及方法；第四章主要介绍核酸和蛋白质序列的比对方法及应用，着重讲述双序列比对的原理和常用工具；第五章和第六章主要介绍多序列比对的原理和常用工具，包括Clustal工具及利用Mega软件进行系谱分析；第七章和第八章主要介绍基因组注释及基因结构分析的主要内容、方法及工具；第九章和第十章则分别介绍从蛋白质序列分析其基本理化性质、结构和功能的方法及其在研究中的应用；第十一章主要介绍核酸序列的分析，包括核酸序列的拼接及编辑，设计引物及克隆软件等。
售价：15.20

系统生物学(供生物信息学生物学生物医学工程智能医学等专业用高等院校教材)
所属分类：生物科学>>生物科学>>普通生物、细胞生物学作者：编者:朱作斌//张潇//王亮|责编:杨凡出版社：东南大学
系统生物学是研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生，以系统论、实验和计算方法整合研究为特征的生物学。 20世纪中页贝塔朗菲定义“ 机体生物学”的“机体”为“整体”或“系统”概念，并阐述以开放系统论研究生物学的理论、数学模型与应用计算机方法等。系统生物学不同于以往仅仅着重个别的基因和蛋白质的分子生物学，而在于细胞信号传导和基因调控网路、生物系统组成之间相互关系的结构和系统功能的研究。系统是由相互依赖并由此互连的组件组成的网络而构成的统一整体。本书首先介绍系统生物学概况，然后分类介绍系统生物学中各分系统的理论知识及相关技术操作，最后介绍利用系统的思想解决进化问题和医学问题的优势及面临的困难。本书内容主要包括：系统模型和生物学网络、DNA系统、RNA系统、蛋白系统、糖组学系统、代谢系统、表观系统、相互作用组学、生物学数据库、生物大数据挖掘、系统生物学与进化、系统生物学与疾病研究。
售价：19.60

信息遗传学概论(英文版香农信息科学经典)
所属分类：生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学作者：(法)杰拉德·巴特尔|责编:陈亮//夏丹出版社：世界图书出版公司
遗传可被视为是极长时间尺度上的基因组信息传递。然而，基因组会在像人类生命这样短暂的时间尺度上产生偶发性错误（即突变），并可能导致显著的影响。香农1948年发表的《通信的数学原理》开创了信息论这一新领域，证明了通过一个不可靠（即可能出现错误）的信道进行可靠的信息传输是可能的，但能可靠传递的信息有一个容量，超过了这个极限，可靠通信就不再可能了。近年来随着 Turbocodes等纠错编码的发明，在电子通信工程中以接近容量的方式可靠地传输信息已成为现实。我们日常生活的很多电子设备（如手机、CD、DVD、数字电视等）若没有高效的纠错码是无法工作的。遗传作为自然界在长久以前已解决的一个工程问题，也能用信息论的角度来研究。DNA的传输容量很容易以指数形式迅速衰减，这意味着必须使用纠错码来再生基因组，才能可靠地传递遗传信息。假设这样的纠错编码确实存在，就可以解释生命世界的基本特征，如分立物种及其等级分类，连续世代的必需性，甚至是向复杂生物进化的趋势。本书有两大目的，一是向遗传学家展示信息论和纠错编码是遗传信息传递的必要工具，还讨论了使用它们的一些生物学结果，并提出了基因编码的假设猜测。另一个目标是促使通信工程师对遗传学和生物学产生兴趣，以拓宽他们的视野，超越技术领域，向最杰出的工程师大自然学习。
售价：35.60

喘息--氧气温度与鳃呼吸动物的生长/海洋生态科学与资源管理译丛
所属分类：生物科学>>生物科学>>遗传学、生理学作者：(加)丹尼尔·保利|责编:屠强//王溪|译者:杜建国//陈明茹//王枫//叶观琼|校注:周秋麟//杨圣云出版社：海洋
丛书项：海洋生态科学与资源管理译丛
这本书从鱼类和无脊椎动物的生长基础、鳃面积限制效应的证据、季节性生长波动、生长与繁殖的关系、鱼类体内pH的动态变化及其与生长的关系、全球变暖背景下的鱼类分布和生产力等多个方面，系统阐述了鳃 -氧限制理论。本书并不仅仅是对原著照本宣科的翻译；为了中文版的出版，作者重新修订了文本和图表，并补充了最新文献。
售价：48.00

生物信息分析基础(供生物技术合成生物学生物工程及食品类药品类等专业用医药高等职业教育本科规划教材)
所属分类：生物科学>>生物科学>>生物工程学作者：编者:孙妍|责编:卜琦鑫出版社：中国医药科技
本教材以学生职业需求和社会发展为出发点，立足于“学生为中心”的课堂模式，以职业本科学生能力发展为设计主线，帮助学生建立解读生物信息，探索生命奥秘的知识与技能基础，力争打造生动、立体的课堂、激发学生学习的兴趣与主动性。全书包含学习生物信息分析所需要的基础生物知识；核酸数据库、蛋白质数据库、序列比对和分子的系统发育和进化的实践课堂；以及基因组学基础和蛋白组学基础的扩展知识。本教材主要供高等职业教育（职业本科和高职高专）生物相关专业、药学相关专业的师生教学使用，也可以供相关从业人员基础培训使用。
售价：15.60

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